Protein–RNA interactions for Protein: Q8C570

Rae1, mRNA export factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rae1Q8C570 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rae1Q8C570 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rae1Q8C570 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms