Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms