Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssuh2Q8C3L1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssuh2Q8C3L1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms