Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q8C1R3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8C1R3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms