Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TnrQ8BYI9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TnrQ8BYI9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms