Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cldn17Q8BXA6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cldn17Q8BXA6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cldn17Q8BXA6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms