Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vps13cQ8BX70 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms