Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVM7

Als2cr12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2cr12Q8BVM7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Als2cr12Q8BVM7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Als2cr12Q8BVM7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms