Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pggt1bQ8BUY9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pggt1bQ8BUY9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms