Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rd3Q8BRE0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms