Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms