Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp1Q8BJQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp1Q8BJQ2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms