Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q8BGC1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q8BGC1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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