Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Htatsf1Q8BGC0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htatsf1Q8BGC0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms