Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Smim19Q80ZU4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Smim19Q80ZU4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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