Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrfn4Q80XU8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms