Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sgo2Q7TSY8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms