Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms