Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMF2

Eri1, 3'-5' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri1Q7TMF2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Eri1Q7TMF2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Eri1Q7TMF2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms