Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Eci3Q78JN3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms