Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd3eapQ76KJ5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd3eapQ76KJ5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms