Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ9

Myl12a, MCG5400, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl12aQ6ZWQ9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Myl12aQ6ZWQ9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myl12aQ6ZWQ9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms