Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LcorQ6ZPI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LcorQ6ZPI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms