Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdk2Q6V4S5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdk2Q6V4S5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms