Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8b3Q6UQ17 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Atp8b3Q6UQ17 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8b3Q6UQ17 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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