Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GcsamQ6RFH4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GcsamQ6RFH4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms