Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc57Q6PHN1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms