Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gramd2bQ6PEM6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gramd2bQ6PEM6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms