Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyp2d40Q6P8N9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp2d40Q6P8N9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms