Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6I6

Polr2m, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2mQ6P6I6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr2mQ6P6I6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Polr2mQ6P6I6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms