Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nwd2Q6P5U7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nwd2Q6P5U7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms