Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SphkapQ6NSW3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SphkapQ6NSW3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SphkapQ6NSW3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms