Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap5lQ6GQX2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nckap5lQ6GQX2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nckap5lQ6GQX2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms