Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp11bQ6DFW5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp11bQ6DFW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms