Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sv2cQ69ZS6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sv2cQ69ZS6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms