Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn4Q69Z26 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn4Q69Z26 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms