Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nlrp9bQ66X22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nlrp9bQ66X22 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms