Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Tbr1Q64336 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tbr1Q64336 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tbr1Q64336 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tbr1Q64336 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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