Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp248Q640N4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Zfp248Q640N4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Zfp248Q640N4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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