Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lcn4Q62472 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lcn4Q62472 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Lcn4Q62472 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lcn4Q62472 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Lcn4Q62472 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Lcn4Q62472 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lcn4Q62472 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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