Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm20854Q62461 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm20854Q62461 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms