Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Lrp1b-212ENSMUST00000204204 798 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Olfr181-203ENSMUST00000205742 1104 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prm3Q62100 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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