Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccne1Q61457 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccne1Q61457 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms