Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tfap2bQ61313 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms