Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TmpoQ61033 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TmpoQ61033 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms