Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms