Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik1Q60934 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik1Q60934 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms