Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf8Q60846 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf8Q60846 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms