Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn2dQ60773 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2dQ60773 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms