Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cdkn2cQ60772 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cdkn2cQ60772 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms